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Investigación y Proyectos

Avanzamos las fronteras de la bioinformática

Trabajamos en la interfaz entre computación y ciencias de la vida, creando métodos, algoritmos y software para comprender cómo interactúan y funcionan las biomoléculas.

Cada línea de investigación avanza junto con la ingeniería: muchos de nuestros proyectos generan herramientas y bases de datos abiertas usadas por la comunidad científica en todo el mundo.

En curso

Proyectos actuales

Líneas de investigación activas y el software que nace de ellas. El laboratorio sigue el ciclo investigación → herramienta → publicación.

En curso

Atlas de interfaces péptido-proteína

Caracterización estructural a gran escala de complejos péptido-proteína, con firmas basadas en grafos para apoyar el diseño de péptidos.

PéptidosInterfacesGrafos
Herramientas: Propedia2 · Propedia
Producción: Propedia v2.3 (2023)
En curso

Estructuras de interacción ARN-proteína

Organización y análisis de estructuras de interacción ARN-proteína en una base de datos pública, abriendo camino a nuevos descubrimientos.

ARNEstructurasBase de datos
Herramientas: RNApedia
Producción: RNApedia (2024)
En curso

Contactos moleculares análogos y optimizados

Detección, comparación y optimización de contactos en estructuras y complejos de proteínas, acelerando el análisis estructural.

ContactosEstructurasAlgoritmos
Herramientas: VTR · COCaDA · nAPOLI
Producción: COCaDA (2024) · VTR (2021)
En curso

Ingeniería de enzimas y efectos de mutaciones

Modelado del impacto de mutaciones en proteínas y enzimas, con énfasis en beta-glucosidasas y variantes de interés biotecnológico.

EnzimasMutacionesModelado
Herramientas: Glutantbase · E-Volve · SSV · MutaGraph
Producción: Glutantbase (2020) · E-Volve (2022)
En curso

IA para descubrimiento de fármacos y péptidos

Modelos de aprendizaje automático para priorizar candidatos, predecir interacciones y acelerar el ciclo de descubrimiento. [Resumen para revisión por el laboratorio]

Aprendizaje automáticoDescubrimiento de fármacosPéptidos
Producción: Línea de investigación en expansión
En curso

Visualización y software científico

Plataformas para manipular, normalizar y visualizar estructuras y mutaciones, haciendo que los datos complejos sean accesibles y reproducibles.

VisualizaciónSoftwareReproducibilidad
Herramientas: PDBest · VERMONT · Proteus
Producción: PDBest · VERMONT · Proteus